El Consejo Rector es el órgano superior de gobierno y administración del Consorcio. Está integrado por los siguientes miembros:
- Presidente de Honor: Sr.D. Íñigo Méndez de Vigo y Montojo. Ministro de Educación, Cultura y Deportes.
- Presidente: Sra. Dª. Miriam García Cabezas. Secretaria General de Cultura de la Junta de Extremadura
- Vicepresidentes:
- Sr. D. Francisco Pérez Urban . Director General de Bibliotecas, Museos y Patrimonio Cultural de la Junta de Extremadura
- Sr. D. Luis Lafuente Batanero. Director General de Bellas Artes y Conservación y Restauración de Bienes Culturales del Ministerio de Educación Cultura y Deportes
- Sr. D. Antonio Rodríguez Osuna. Alcalde de Mérida.
- Sr. D. Miguel Ángel Gallardo Miranda. Presidente de la Diputación Provincial de Badajoz.
- Sra. Dña. Blanca Martín Delgado. Presidente de la Asamblea de Extremadura.
- Vocales:
- Dos representantes del Ministerio de Cultura, de los cuales uno de ellos será el/la Director/a del Museo Nacional de Arte Romano de Mérida
- Cinco representantes de la Junta de Extremadura, de los cuales:
. Dos designados/as por la Consejería de Cultura
. Uno/a designado/a por la Vicepresidencia de la Junta de Extremadura
. Uno/a designado/a por la Consejería de Agricultura y Medio Ambiente
. Uno/a designado/a por la Consejería de Educación
- Tres representantes del Excmo. Ayuntamiento de Mérida, que representen a los grupos políticos mayoritarios
- Representante de la Diputación Provincial de Badajoz
- Representante del Parlamento de Extremadura
- Secretario/a: El/la Secretario/a será un funcionario de la Secretaría General de Cultura de la Junta de Extremadura.
Asistirán a las reuniones del Consejo Rector, con voz y sin voto, los siguientes miembros:
- Un representante del Colegio Provincial de Arquitectos de Badajoz
- Un representante de la Asociación Provincial de Empresarios de la Construcción de Badajoz
- Un representante de las Asociaciones de Defensa del Patrimonio
- Un representante de la Federación de Asociación de Vecinos
-Un representante de la Asociación de Comerciantes de Mérida
- Hasta un máximo de cuatro personas de reconocido prestigio en el campo del patrimonio cultural, designados por el Consejo Rector
- Un representante de los Trabajadores del Consorcio
- Un representante de los "Eméritos del Patrimonio" del Consorcio.
- El Director del Consorcio
- El Gerente del Consorcio.